Алишер Саипов был кыргызским журналистом, он выпускал газету Сиозат, на узбекском языке, в которой обличал нарушения прав человека узбекскими властями. Саипов резко критиковал президента Узбекистана Ислама Каримова и его правительство. Темой его репортажей становились пытки в узбекских тюрьмах, пресечение инакомыслия, угроза исламского радикализма. Он также готовил репортажи для Радио Свобода и радио Голос Америки. Он был застрелен 7 октября 2007 года на улице недалеко от своей редакции в городе Ош.

Кыргызские следователи подозревают, что в убийстве могут быть замешаны узбекские спецслужбы. «Международная кризисная группа», утверждает, что есть «веские аргументы» подозревать узбекских агентов. В апреле 2009 года официальные лица объявили, что они арестовали бывшего полицейского Абдуфарита Расулова за убийство и обнаружили орудие убийства. Однако судья Ошского городского суда постановил, что для судебного разбирательства недостаточно доказательств. Прокуроры подали апелляцию, и судья был заменен. 9 декабря 2009 года Верховный суд Кыргызстана постановил, что судебное преследование подозреваемого Абдуфарита Расулова, может быть продолжено после обращения отца Алишера Саипова, который назвал это дело «фиктивным». Согласно Uznews, Расулов отрицал причастность к убийству и утверждал, что он был избит полицией. Комитет защиты журналистов открыто заявил, что «отказ начать новое расследование убийства Алишера Саипова лишь усиливает впечатление, что власти Кыргызстана с меньшим пиететом относятся к правосудию, чем к постыдным дипломатическим договоренностям». «Радио Свободная Европа» критиковала решение, заявив: «Путаница и противоречия вокруг расследования предоставили де-факто безнаказанность убийцам Саипова и подняли вопросы о решимости правительства Кыргызстана найти и наказать виновных». В 2010 году Расулов был признан виновным и приговорен к 20 годам тюремного заключения.

25 октября 2012 года, замминистра внутренних дел республики Кыргызстан Мелис Турганбаев выступил с заявлением, что расследование дела Саипова будет возобновлено.